原讼法庭将设几个地方和地区分庭，以及一个位于巴黎的中央分庭。 德国是欧洲最重要的专利侵权诉讼法院所在地，地方分庭最多，有 杜塞尔多夫、曼海姆、慕尼黑、汉堡。 这使得德国成为具备最大 UPC 诉讼受理能力的国家。 UPC 的上诉法庭设在卢森堡。
诉讼可向所有分庭提起并由其受理。 通常，侵权案件将由提起诉讼的分庭进行受理。 与以前一样，这也可在发生侵权的司法辖区的分庭进行。 如果被告在欧盟以外，则位于巴黎的中央分庭有管辖权。
其特殊性在于一个分庭既可以审判专利侵权，也可审判专利有效性。 通常，这在具备相应能力的地方分庭或地区分庭进行。 但在个别案件中，侵权和有效性可能在不同的诉讼中进行审判。 如果当事各方同意，也可以将整个案件移交巴黎的中央分庭处理。
对于费用分配，适用已经在德国实施的原则： 向 UPC 提起的诉讼的法庭费用由原告支付。 包括律师费在内的赔偿由败诉方承担。
